[Linux-ivv4] Gaussian auf NWZSuperdome

[Christian Mück-Lichtenfeld]

Liebe Kolleg(inn)en,

auf NWZSUPERDOME steht das Gaussian-Programm für quantenchemische
Rechnungen bereit. Das Programm erfordert die Festlegung auf eine 
Usergruppe, die es ausführen darf. Bedingung für den Einsatz von Gaussian
ist daher zur Zeit die Mitgliedschaft in der Gruppe "q0mitarb".
Evtl. findet sich in Kürze eine bessere Lösung für das Problem.

Bitte führen Sie die Rechnungen in einem lokalen Verzeichnis aus:

mkdir /work/{username}
cd /work/{username}

Im PBS-Job-Skript muss der Befehl 
 
	run-g03 {inputfile} {outputfile}

( {} Filenamen bitte ersetzen ) eingefügt werden.
run-g03 befindet sich in /opt/qc/bin, entweder man fügt also dieses
Verzeichnis seiner PATH Variablen hinzu oder ruft Gaussian 
mit "/opt/qc/bin/run-g03" auf.

Die Zahl der CPUs im PBS-Skript und im Gaussian-Input muss
übereinstimmen, also z.B.:

#PBS -l nodes=1:ppn=4		(im PBS-Skript)

  und 

%nprocshared=4		(im Gaussian-Input)

Mit erscheint die Performance in einigen ersten Testrechnungen
ausgezeichnet. Ich bitte um Rückmeldung bei Problemen oder
Fragen (bin allerdings die nächsten zwei Werktage nicht im Institut).

Viele Grüße,

Christian Mück-Lichtenfeld






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Dr. Christian Mück-Lichtenfeld
Westfaelische Wilhelms-Universität
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(Henry Kissinger)